sábado, 30 de junho de 2012

VÍRUS: NOSSO INIMIGO OU PARENTE LONGÍNQUO.


Os novos avanços da ciência especialmente na área da decodificação genética têm trazido ao mundo gratas surpresas como a possibilidade de tratamentos de doenças até então consideradas incuráveis.
Na outra ponta desses avanços estão os estudos de biologia genética onde as mais recentes descobertas sobre os genomas  virais e sua relação com os seres humanos, tem demonstrado a importância dos vírus na sua interação com o hospedeiro humano, inclusive como mecanismo para permitir-lhe melhor adaptação ao ambiente e manter a vida.
A entrevista do pesquisador Gilbert Clèment,  do Labortório de Ecologia e Biologia das Interações (CNRS) - da Universidade de Poitiers na França, traz interessantes informações sobre o assunto.
Descubra aqui, como se enganam aqueles que acreditam serem os vírus totalmente nocivos ao ser humano e à vida.
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OS HUMANOS SÃO PARENTES DOS VÍRUS.
Entrevista com Clement GilberT


 
Gilbert Clement é pesquisador do laboratório de ecologia e biologia das interações (CNRS-Universidade de Poitiers). Com Cedric Feschotte, Professor da Universidade do Texas em Arlington, ele publicou recentemente um artigo em genética com comentários sobre a natureza dos vírus endógenos. O genoma do vírus é integrado para todos ou em parte no genoma da espécie host (hospedeiro) - (incluindo o caso humano), o que abre uma janela fascinante na evolução do mundo viral.

Os filmes como Contágio ou os alertas midiáticos  sobre a gripe viral H1N1 ou a gripe aviária, dão ao público a mesma imagem do vírus patogênico e perigoso. Portanto a imagem que percebem através da ciência não é muito diferente da que se apresenta nos clichês. Portanto a imagem que se passa através da ciência não é parecida com a da propaganda?

Na verdade, nossa compreensão do mundo dos vírus e suas interações com o resto da vida tem mudado nos últimos anos. Primeiro, se deve perceber que a má reputação do vírus estava sendo construída em torno de efeitos - embora às vezes devastadores - causada em humanos, por uma pequena proporção de todos os vírus presentes em nosso planeta. Menos de uma dúzia é responsável por doenças virais mais comuns em nossas regiões, como o resfriado comum, gripe, catapora, sarampo. Se for normal que esse pequeno número de vírus nos preocupe particularmente, deve-se saber que a esmagadora maioria do vírus não só não pode infectar seres humanos, mas desempenha um papel crucial em seu "ecossistema" interno. O corpo humano de um adulto saudável é lar de mais de três trilhões de vírus,  a maioria deles bacteriófagos, infectantes das bactérias do trato intestinal e membranas mucosas. O impacto destes vírus ainda não é completamente compreendido, mas já podemos apostar que eles desempenham um papel importante na regulação da composição das comunidades de bactérias que vivem em simbiose com os seres humanos.

Os vírus não são apenas numerosos, mas é sabido agora que eles exibem uma diversidade genética muito grande...

Nosso conhecimento da diversidade genética e a ecologia do vírus permaneceram muito limitados até meados da década de 2000, onde novas tecnologias de sequenciamento de DNA foram colocadas no mercado. Hoje, as máquinas produzem até 120 bilhões de pares de bases (o equivalente a 40 genomas humanos) em 24 horas a um custo de dez mil vezes menor do que o método usado na década de 1990 para sequenciamento do primeiro genoma humano. Genomas virais, entre três mil e três milhões de vezes menor do que o nosso, deixo que você calcule a quantidade de novos genomas virais que podem ser teoricamente serem sequenciados por ano. Esses métodos são usados regularmente para sequenciar genomas, denominados de metagenomas, ou seja, os genomas de todos os microorganismos em um ponto, em um determinado ambiente, como um litro de água do mar, um quilograma de solo ou até mesmo algumas gramas de fezes humanas.

Um dos principais resultados do método metagenômico foi revelar a incrível diversidade genética do vírus. Por exemplo, um estudo mostrou que um quilograma de sedimento marinho  coletado na Costa da Califórnia poderia conter até 1 milhão de genótipos virais. Além do mais, entre 75 e 90%  das sequências  produzidas entre todos os estudos metagenômicos  virais publicados depois de 2002 não foram ainda homologados dentro do  banco de dados de genomas já seqüenciados.
Em outras palavras, essas sequências são genes que não se parecem com nenhum conhecido gene até então. Os vírus assim formam um quase infinito reservatório de genes e alguns acreditam que este reservatório foi e ainda é uma importante fonte de novidade genética sem as quais  formas de vida como as de  hoje (incluindo a nossa própria espécie) nunca teriam existido.

O artigo que recentemente você publicou trata de vírus endógenos, que são eles?

Em parte os vírus endógenos podem descrever genomas ou fragmentos de genomas virais integrados  no genoma de suas espécies e transmitidos de forma hereditária de geração a geração.
Agora, sabe-se que, desde a origem dos vertebrados, há cerca de 500 milhões de anos, muitas inserções de retrovírus são produzidas no genoma dos gametas (espermatozóides e óvulos) de suas espécies de hospedeiros. Algumas dessas inserções envolvendo o genoma viral incapaz de continuar a replicar ou suficientemente atenuadas para não afetar a fertilidade de seu hospedeiro, poderiam ser transmitidos de forma hereditária, a todos os descendentes da espécie em que eles ocorreram originalmente. O resultado deste longo processo de acumulação de sequências de origem retroviral no genoma dos vertebrados é surpreendente, mesmo preocupante, já que parece que mais do que 8% no genoma humano são derivados de retrovírus. Em outras palavras, dado que dos  3,50 bilhões de pares base de nosso genoma, cerca de 300 milhões são de origem  viral, como poderíamos dizer que nós de alguma forma não estamos relacionados com o vírus!
Os Retrovírus permaneceram por mais de quarenta anos os únicos vírus conhecidos com a capacidade de se tornar endógeno. Na verdade somente nos últimos três anos é que se percebeu que qualquer tipo de vírus pode se tornar endógeno dentro de qualquer organismo eucariotac, mesmo se esses vírus endógenos forem muito mais numerosos do que os retrovírus endógenos. No entanto, sua análise já revelou tesouros de informações relativas a coevolução entre vírus e seus hospedeiros a longo prazo.

Assim como existe a paleoantropologia, existe agora um paleovirologia. O que pode esta janela da história dos vírus nos ser útil?


como os paleoantropólogos que estudam fósseis de primatas e o ambiente em que viviam, os paleovirólogos estudarão os fósseis moleculares do vírus, ondas de rastreamento do passado de infecções viral e buscarão compreender como as organizações têm sido capazes de lutar contra esses ataques repetidos. Este conhecimento contribuirá não só para preencher uma lacuna em nossa compreensão da evolução do vírus no médio-longo prazo, mas fornecerão uma estrutura conceitual que é importante para o desenvolvimento de novas estratégias  médicas para combater o vírus. Em relação a avanços na compreensão da evolução do vírus, por exemplo, mostrou-se que vírus endógenos, pertencente à família Hepadnaviridae (que inclui o vírus da hepatite B, na foto) foram integrados no genoma do ancestral de um grupo de pássaros há mais de 19 milhões de anos. Esta descoberta mudou completamente a nossa maneira de compreender a evolução desta família viral a partir de  2010, alterando a idéia de o pensamento de que o vírus da hepatite b havia surgido a menos de 30 000 anos. Não se sabe se o vírus da hepatite b ainda circula hoje em aves, mas este estudo mostra que seria aconselhável realizar testes em várias espécies dessas aves. Na verdade, isso poderia permitir que um novo modelo animal mais fácil de estudar e manipular para o estudo do vírus.


Vários trabalhos publicados por Sara Sawyer (Universidade do Texas, Austin) e Harmit Malik (Fred Hutchinson Cancer Research em Seattle) buscam dissecar as forças evolutivas que governam os genes para resistência aos vírus, notadamente nos primatas. Seus resultados mostram que a seqüência destes genes mudou muito mais rápido que todos os outros genes codificados pelo genoma humano, e que esta rápida evolução mostra a corrida ao armamento que os primatas são praticando contra o vírus desde milhões de anos.
Em outras palavras, estes genes são adaptados incansavelmente para estratégias de ralaxamento do controle, continuamente renovadas, utilizadas por alguns vírus entrar em nossas células e executar o seu ciclo de replicação, frequentemente às nossas custas. Numa perspectiva mais aplicada, esses estudos também têm se caracterizado com interfaces de contato de precisão, ou seja, o campo de batalha molecular entre certos vírus e certas regiões de proteínas antivirais humanas. Essas descobertas têm oferecido pistas para desenvolver novos medicamentos antivirais, alguns agora,  objeto de extensa pesquisa.

Não poderemos considerar os vírus patogênicos como aqueles que perderam sua corrida evolutiva?

Talvez seja melhor dizer que esses vírus estão em período de aprendizagem... Mas é uma imagem interessante porque mostra que a própria de um vírus não é ser patogênico, ou em conflito permanente com seus anfitriões. Em qualquer caso é a idéia que parece corroborar certos resultados da análise da sequêncial de vírus endógenos. No caso do Hepadnaviridae, por exemplo, o cálculo da idade destes vírus baseou até 2010, a uma taxa de mutação estimada a partir de comparações de seqüências de hepatite b patógeno de homens infectados. Como afirmei acima, a idade obtida por este método é muito inferior (30 000 anos) anos, obtido pela datação da hepatite b endógeno encontrado em Passeriformes (19 milhões de anos). Além disso, a taxa de mutação dos hepadnaviridae calculada em 19 milhões de anos é mil vezes mais lenta que o vírus que circula atualmente nas populações humanas. Embora vários potenciais problemas metodológicos tenham sido propostos para explicar essa diferença, eles parecem insuficientes para explicar uma diferença de três ordens de magnitude.

hepatite B - vírus
hepatite B - Vírus
 
Como Cédric Feschotte, propusemos em 2010 que esta diferença poderia refletir uma realidade biológica. A hipótese seria que o vírus da hepatite b atual encontrado em seres humanos são agentes patogénicos, porque eles estão circulando relativamente a pouco tempo. Eles seriam "mal adaptados", incapazes de se manter sem causar muito dano. O sistema imunológico dos seres humanos, também mal adaptado para o vírus é incapaz de tolerar, o que gera um conflito em evolução, uma corrida armamentista. A resposta imune humana estimula o vírus para replicar, se transformar e evoluir muito rapidamente, daí as taxas de substituição muito rápida obtidas nas seqüências patogênicas atuais. Propomos que este tipo de desequilíbrio não reflete a evolução a longo prazo do Hepadnaviridae, e que na maioria das vezes a partir de 19 milhões de anos atrás, esses vírus evoluíram em paz com seu hospedeiro, sem induzirem a patologia e bem tolerados pelo seu sistema imunológico. Em geral, este estudo de caso nos levou a acreditar que nosso conhecimento sobre a dinâmica evolutiva de vírus são provavelmente tendenciosas, porque até agora os estudos foram direcionados especialmente para vírus patogênicos.

Possuir em nosso genoma vírus tem sido uma coisa favorável ou não?

A integração do genoma viral nos cromossomos de seu hospedeiro é, naturalmente, não sem risco para o hospedeiro. Isso pode levar a redução completa, uma inativação do gene ou o aumento da sua atividade. Estes três tipos de efeitos são prováveis para causar  perturbações do tecido afetado que pode levar ao desenvolvimento de cânceres. Em gato doméstico por exemplo, vários estudos têm mostrado que a introdução do vírus da leucose felina de tipo b dentro ou em torno de seis genes pode levar ao desenvolvimento de linfoma, leucemia ou anemia. O retrovírus inserido em nosso genoma desde milhões de anos e completamente inativos também são capazes de causar problemas de forma mais indireta, provocando rearranjos cromossômicos de diversas patologias. Por exemplo, a recombinação entre duas cópias de um retrovírus endógeno humano chamado HERV15, localizado no cromossomo pode causar o desaparecimento de uma região genômica ao longo de 800.000 pares de bases. Estes resultados de exclusão na perda de um gene chamado "fator de azoospermia 1" em homens carregando este rearranjo, levam à esterilidade.

Da mesma forma sou levado a pensar que os problemas, sobretudo os mais raros, causados por vírus endógenos, são um magro tributo a pagar em comparação com os enormes benefícios evolutivos que essas sequências virais tem trazido a seus anfitriões durante milhões de anos.
A grande quantidade de DNA adicionado ao genoma humano pela integração de retrovírus endógeno formou um terreno muito fértil de material bruto, reciclado muitas vezes em sequências que vão preencher agora várias funções celulares vitais.
Tomemos por exemplo o caso de genes humanos chamado syncytin 1 e 2, que estão envolvidos na Formação da placenta. Eles São derivados um gene retroviral, codificação de uma proteína que  normalmente permite que o vírus se funda com a membrana da célula hospedeira e penetre no interior do compartimento. O syncytines mantém sua capacidade   fusogênica de origem, mas eles estão agora envolvidos dentro da fusão das células  da placenta para formar uma camada que permite a troca nutrientes entre mãe e o feto. Thierry Heidmann (Institut Gustave Roussy Villejuif) mostrou que esses dois genes humanos foram derivados de dois retrovírus endógenos diferentes integrados ao dentro do genoma de   primatas que o transmitiram há cerca de 40 milhões de anos. É muito intrigante e fascinante perceber que o ninho onde todos nós fomos banhados durante os nove primeirose meses nossas vidas certamente não teria sido tão confortável se o vírus não existe...
Este exemplo e muitos outros demonstram como seríamos reducionistas se considerássemos os vírus simplesmente como parasitas, perigosos e inúteis.
Entrevista por Pierre Barthélémy (@PasseurSciences sur Twitter)

M blogs – 28maio2012.

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